写真は6/8拍子なので、3/8拍子で1小節を2小節に分割して、
真ん中の小節線は「非表示」にし、2小節目は「小節番号にカウントする」
からチェックを外し、その上で「小節の左端のスペース」
でスペースを確保する事も考えました。

ただ、ピアノだけでなく、編成に複数の楽器を含み、
かつ1,000小節弱の楽譜なので「リンクしたパート譜」を使用しています。

そのため、あまりややこしい設定をしない方が良いのでは…とも思います。

「道具箱ツール」→「音符配置ツール」での調整も考えていますが、
何か良い方法はありませんでしょうか。

お忙しいところ恐れ入りますが、どうぞよろしくお願い致します。

あの鮮やかな朱色はアーティキュレーションのカラーリングなのですね。
ご質問の楽譜の場合、「ファイル別オプション - スペーシング」にて、
「衝突を避ける項目」の「アーティキュレーション」にチェックを付けた状態で
再スペーシングをしてみてください。
アルペジオのスペースが確保されるはずです。

ここにチェックが付いていると、幅を持つアーティキュレーションを付けた場合、
余計なスペーシングが生じてしまいます。
もし、アルペジオとペダル記号が同じ小節にある場合は、
どちらもスペーシングの対象になってしまいます。
これを避けたければ他の方策を考えなければなりません。

２小節目１拍目の臨時記号は、色からするとアーティキュレーションで貼り付けているのですか？
このような次小節の、いわゆる親切臨時記号は強制表示させることもできますし、
「警告の臨時記号」プラグインを使えば、曲全体を一括して付けてくれることはご存じですか？

室長様

いつもありがとうございます。

幸いペダル記号はアーティキュレーションではないので、
お教え頂いた方法で解決出来そうです。

大変助かりました、ありがとうございます。

ご指摘の様に、アーティキュレーションを朱色に設定しています。

この楽譜データは先方からお預かりしている状態なのですが、
これもご指摘の様に、アーティキュレーションによる臨時記号が付されています。

…ただし、臨時記号のアーティキュレーションと実際の音高が一致しない
（実際にはナチュラルだが、フラットのアーティキュレーションが付されている、等）
箇所が多いため、アーティキュレーションを朱色にして、実際の音符の臨時記号と
擦り合わせをしている…という状況です…。

ご教授頂いた親切臨時記号の強制表示や、「警告の臨時記号」のプラグインは、
これまで使った事が無かったのですが、今回のこのお預かりしているデータで
とても有意義な様に思います。

こちらも大変助かりました、併せてありがとうございます。

室長も仕事がら他人のFinaleデータを浄書することが多いのですが、
同様に親切臨時記号がことごとくアーティキュレーションで貼り付けてあったり、
タイをスラーで描いていたりといった楽譜をよく目にします。
一度限りの仕事なら「仕方ないな」で済ますのですが、
今後も継続的にデータを扱うのであれば、
先方にFinaleの操作をお伝えしたほうがお互いの幸せになると思いますよ。
（まあ、立場上、具申しにくいということあるかもしれませんが……）

室長様

ご親切にありがとうございます。

確かに継続的にデータを扱う場合、お伝えした方が良いでしょうね。
過去にタイをスラーで…という方もいらっしゃいました。

今の所、継続的にデータを扱う事になるか、はっきりしないため、
継続する場合、折を見てお伝えしようかと考えています。
（おっしゃる様に、立場の問題もあるのですが…。）