曲中のアクセントについて一律にプレイバック効果を無効にしたければ、
アーティキュレーション設計ダイアログにて「プレイバック効果」を「なし」にしてしまえば、
アクセントは無視されるようになります。

でも、それで良いのですか？

アーティキュレーションで入力したアクセントは反映されていてほしいです
発想記号(文字)でマルカートを付けたときに、キースイッチが変わってしまうのか、それまでと全然違う音色になってしまうのが好みじゃないなぁという状況です

発想記号でのマルカートのプレイバック設定はないでしょうか？

「発想記号」という部分を完全に見落として、
てっきりアーティキュレーションのことと勘違いしておりました。
（エイプリル・フールということでお許しください……そこじゃない？）

改めて、発想記号のmarcatoを楽譜に付けて、
いくつかの音色、音源でプレイバックしてみましたが、
特に聴感上の違いはみられませんでした。
音色と楽器は何をお使いでしょうか。

音源にはgarritanのGPO5を使っています
楽器はトランペット(trumpet 1 solo KS)
ホルン(french horn 1 solo KS)です
今聞き直してみたところ、ミュートのキースイッチになってる感じがします

試しに新規ファイルでも同じようにマルカートをつけてみましたが、同じように音色が切り替わってしまいました。
記譜用フォントも違うもの(finale maestro→finale legasy)にしてみましたが尚もかわらずでした。

室長は製品版のGPOは持ち合わせていないので検証はできませんが、
GPOのキースイッチについて調べて分かったことがあります。
製品版のGPOにはDAW用の音源"Standard"と、楽譜ソフト用の音源"Notation"が付属しています。
https://usermanuals.garritan.com/GPO5/Content/directory.htm
上記を見ると"Standard"ではD0がMarcato、D1が Muteに割り当てられているのですが、
"Standard"と"Notation"ではキースイッチの位置が異なり、
お話を伺う限りではMarcatoのキースイッチでMuteになるということなので、
"Standard"のほうを選択しているのではと思われるのですが、いかがでしょうか。

音源確認しましたがnotationの方になっていました。
ならばstandardに変えてみては、と試してみたのですが
そうすると楽譜上のcon sord.の指示などに反応しなくなるようでした。(daw用ということでキースイッチ自分で変えてねということなのでしょうかね)
解決の糸口に近づいていそうな感じはするのに、なかなか意図したものになりません…

音源を持っていない室長は効果を確認できないのですが、
HP初期設定のGPO 5のブラスの設定に"marcato"の文字列に対する効果があります。
デフォルトではこの効果はオフになっているのですが、
"marcato"に反応するということは、ここがオンになっているのかもしれません。
ご確認ください。

教えてもらったところのアクティブのチェックを外したところ、キースイッチの誤作動が無くなりました！
SAM brassは別の音色扱いかと思って見ていなかったのですが、この項目が適用されていたんですね…

室長さまのおかげで無事に解決することができて本当に助かりました。ありがとうございます！

解決できて何よりです。
GarritanはFinaleと同じMakeMusic社の製品なので、
そのあたりの連携は特に念入りに行われているはずですが、
こういうこともあるのですね。
こちらの環境では、当該の奏法名のチェックがデフォルトで外されているのですが、
もしかしたら、そのあたりは既知の問題だったのかもしれません。